Основной корпус Обер-комендантского дома был в плане прямоугольным, западный фасад его обращен к большому внутреннему двору, образованному одноэтажными службами, с трех сторон охватывающими его. От главного корпуса служебные флигеля, где находились кухня, ледник, конюшня, каретник и т. д., отделялись воротами. Через эти ворота подъезжали к парадной лестнице, два наружных марша которой с разных сторон вели прямо в вестибюль второго этажа.

Одноэтажный дом слева от главной аллеи, идущей от Петровских ворот, – одна из наиболее старинных построек в крепости. Это Инженерный дом. Вместе с длинным, тоже одноэтажным корпусом Артиллерийского цейхгауза Инженерный дом составляет род пропилеев, ведущих в глубь территории крепости. Свое название Инженерный дом получил по первоначальному назначению: в нем размещалась инженерная команда, которая вела строительные работы в крепости.

В архитектуре Ботного дома проявились черты и стиля барокко и стиля классицизма. Декоративные волютообразные украшения над окнами, расчлененность фриза и карниза над пилястрами и форма площадок у входов говорят о заметном еще влиянии стиля барокко, господствовавшего в России до 1760-х годов. Однако удивительно строгие портики и композиционная простота фасадов – явные признаки зарождавшегося в те годы классицизма, так ярко развившегося в последующие десятилетия.

Московские монетные дворы чеканили новые медные монеты с 1700-х годов, а чуть позднее – и серебряные монеты копеечного и рублевого достоинства. После того как Петербург стал столицей, Петр I решил перенести сюда и монетное производство. 15 марта 1719 года он издал указ о переводе «из Москвы в Санкт-Петербург денежных дворов по ведомству Камер-Коллегии», которой поручалось руководство монетным производством. Однако перевод московских монетных дворов в новую столицу состоялся не сразу.

Ворота в крепости были построены в 1708 году. Они были деревянными. У одного из путешественников, оставившего первое описание Санкт-Петербурга 1710 года, мы находим такие строчки: «Крепостные ворота деревянные, очень красивой резной работы... Над ними возвышается статуя св. Петра в человеческий рост, с двумя большими ключами в руке, тоже деревянная. Внизу выставлен год, именно 1703-й, на портике по правую руку вделана жестяная доска с русской надписью, гласящею об основании крепости.

Никола Пино в 1716 году приехал в Петербург из Франции и занимался отделкой царских покоев. Он зарекомендовал себя прекрасным резчиком по дереву и декоратором. Ему-то в начале 1720-х годов и поручили выполнить декоративные скульптуры для Петровских ворот. Вскоре статуи в человеческий рост, в том числе фигура апостола Петра, увенчали ворота. Барельефные аллегорические композиции на фронтоне и волютах были деревянными, резными.

Оформление въезда в Петропавловскую крепость в виде триумфальной арки так же, как и символическая скульптура на ней, утверждали престиж власти Петра I и прославляли его мудрость и военные успехи, подчеркивали авторитет государственной власти и напоминали современникам о победах России в Северной войне. Во время сооружения Петровских ворот еще не было Иоанновского равелина и ворота были обращены непосредственно к площади города.

Невские ворота были выстроены в 1784-1787 годах. И жители столицы увидели прекрасную композицию с монументальным портиком ясных пропорций и противопоставлением массивных квадр, словно нанизанных на колонны, тонко профилированным капителям и карнизу. Теперь по-новому воспринималась и пристань, ставшая как бы естественной принадлежностью ворот и крепостных стен, облицованных гранитом.

В 1868 году в новое здание из Арсенала на Литейном проспекте перевезли не только орудия и артиллерийские запасы, но и богатые коллекции образцов отечественных пушек «Достопамятного зала». Эти коллекции отражали путь развития русской артиллерии с конца XV века. Начало этому собранию положил Петр I, который особым указом запретил переливать старинную бронзовую мортиру, богато украшенную орнаментом, изготовленную в 1605 году замечательным пушечным мастером Андреем Чоховым и его учеником Проней Федоровым.

Петропавловская крепость никогда не была городским ядром. Город как организм развивался вне крепости. И если первоначально городская застройка шла вблизи ее на Городском острове, примерно в районе нынешней площади Революции, то вскоре городское строительство перенесли на Васильевский остров и Адмиралтейскую сторону, и архитектурно-планировочным центром стало Адмиралтейство.