Комиссия из крупнейших петербургских архитекторов и мастеров разных специальностей установила, что каменные части здания надежны и что надо восстановить только уничтоженные огнем деревянные конструкции. При этом было высказано пожелание: «Во избежание повторения пожаров шпиль, крышу и купол нужно построить вновь, не употребляя нигде дерева», только из огнестойких материалов: железа и кирпича. Восстанавливать собор решено было в прежнем виде.

Ремонтом колокольни без изменения ее вида занимался и архитектор А. И. Михайлов в 1820 году. И все же через несколько лет заметили повреждение венчающего креста с ангелом. Надо было вновь его ремонтировать; для этого необходимо было возвести снизу доверху дорогостоящие леса. Неожиданно на помощь пришел крестьянин-кровельщик Петр Телушкин, который предложил исправить крест и ангела без лесов.

Металлический каркас высотой в 48,5 метра был покрыт медными позолоченными листами и увенчан, как и раньше, крестом и новой фигурой теперь уже стоящего ангела, исполненной по рисунку скульптора Р. К. Залемана. Общая высота шпиля увеличилась на 10 метров, и колокольня достигла 122 метров. Внутри шпиля расположена винтовая лестница, диаметром почти в полтора метра.

С Петропавловским собором крытым переходом соединены расположенные рядом бывшая великокняжеская усыпальница и дом церковнослужителей. Необходимость создания новой усыпальницы была вызвана тем, что во второй половине прошлого века в соборе стало тесно от надгробий, – в соборном зале, кроме царских захоронений, было уже свыше 20 великокняжеских гробниц.

Среди архивных документов сохранились рапорты Доменико Трезини о ходе строительства каменного кавальера. Начиная постройку в августе 1730 года, он докладывал, что «под кавальер под наличные стены сваи под фундамент забиты и рвы копают для обутки фундамента камнем и в скорости оной начнетца бутить...» А в июле 1733 года Трезини сообщил, что «на кавальере 16 сводов с арками свели и между ими разбутили и кругом подняты стены...»

Основной корпус Обер-комендантского дома был в плане прямоугольным, западный фасад его обращен к большому внутреннему двору, образованному одноэтажными службами, с трех сторон охватывающими его. От главного корпуса служебные флигеля, где находились кухня, ледник, конюшня, каретник и т. д., отделялись воротами. Через эти ворота подъезжали к парадной лестнице, два наружных марша которой с разных сторон вели прямо в вестибюль второго этажа.

Одноэтажный дом слева от главной аллеи, идущей от Петровских ворот, – одна из наиболее старинных построек в крепости. Это Инженерный дом. Вместе с длинным, тоже одноэтажным корпусом Артиллерийского цейхгауза Инженерный дом составляет род пропилеев, ведущих в глубь территории крепости. Свое название Инженерный дом получил по первоначальному назначению: в нем размещалась инженерная команда, которая вела строительные работы в крепости.

В архитектуре Ботного дома проявились черты и стиля барокко и стиля классицизма. Декоративные волютообразные украшения над окнами, расчлененность фриза и карниза над пилястрами и форма площадок у входов говорят о заметном еще влиянии стиля барокко, господствовавшего в России до 1760-х годов. Однако удивительно строгие портики и композиционная простота фасадов – явные признаки зарождавшегося в те годы классицизма, так ярко развившегося в последующие десятилетия.

Московские монетные дворы чеканили новые медные монеты с 1700-х годов, а чуть позднее – и серебряные монеты копеечного и рублевого достоинства. После того как Петербург стал столицей, Петр I решил перенести сюда и монетное производство. 15 марта 1719 года он издал указ о переводе «из Москвы в Санкт-Петербург денежных дворов по ведомству Камер-Коллегии», которой поручалось руководство монетным производством. Однако перевод московских монетных дворов в новую столицу состоялся не сразу.

Ворота в крепости были построены в 1708 году. Они были деревянными. У одного из путешественников, оставившего первое описание Санкт-Петербурга 1710 года, мы находим такие строчки: «Крепостные ворота деревянные, очень красивой резной работы... Над ними возвышается статуя св. Петра в человеческий рост, с двумя большими ключами в руке, тоже деревянная. Внизу выставлен год, именно 1703-й, на портике по правую руку вделана жестяная доска с русской надписью, гласящею об основании крепости.